Ближние и дальние взаимодействия

Из основных взаимодействий, составляющих конформационную энергию молекулярной системы, можно выделить три наиболее влиятельных вклада: U нее, U угл, U торс.

Если рассматривать полимерную цепочку, мы можем с очевидностью сказать, что чем дальше друг от друга находятся два взаимодействующих звена, тем слабее они друг с другом взаимодействуют. Если мы выделим фрагмент макромолекулы, перенумеруем звенья 

и найдем парную энергию взаимодействия разных звеньев, например, U 1,3, U 1,4, U 1,10, U 1,n, то наименьшей энергией взаимодействия будет U 1,n.

Если расположить эти величины в ряд, получим

Таким образом, можно сказать, что с удалением звеньев вдоль по цепи уменьшается величина энергии их взаимодействия. Ближайших по цепи звеньев немного, но их взаимодействия сильные. У далеких по цепи звеньев взаимодействия слабые, но их много. Если выделить в цепи некий участок m, включающий в себя несколько звеньев, то внутри этого участка взаимодействия будут считаться ближними, а на расстоянии больше m – дальними: ближние взаимодействия £ m < дальние взаимодействия.